Assessment of the expression of LncRNA (NEAT1) in Human Papilloma Virus associated Head and Neck Cancer

Abstract

Head and neck cancer include the craniofacial bones, soft tissues, salivary glands, skin, and mucosal membranes. More than 90% of it are squamous cell carcinomas, occurs commonly in the oral cavity, oropharynx, larynx and hypopharynx (Dwivedi et al., 2011). HNC represent the sixth most common cancer worldwide with approximately 630,000 new patients diagnosed annually resulting in more than 350,000 deaths every year (Vigneswaran & Williams, 2014). Human papilloma virus considered one of the most risk factors in HNC cases especially the mucosal high-risk types HPV-16 and HPV-18. Nuclear Enriched Abundant Transcript 1 (NEAT1) is a ~3.2 kb novel nuclear long non-coding RNA. It is also known as Virus Inducible Non-Coding RNA, which will be used in this study as a prognostic factor in HPV associated HNC. The present study was conducted on 50 subjects; forty of them were patients suffering from Head and Neck cancer lesions and ten healthy controls. The expression of the Lnc_NEAT1 was measured in all studied subjects using Real time PCR technology Our results reveled high significant difference obtained for the Lnc_NEAT1 expression when HPV positive patients were compared with the negative one. We concluded that NEAT1 can be used as a prognostic biomarker for HNC associated with HPV. يشمل سرطان الرأس والعنق العظام القحفية واألنسجة الرخوة والغدد اللعابية والجلد واألغشية المخاطية. أكثر من 90 ٪ منها هي سرطان الخاليا الحرشفية ، يحدث عادة في التجويف الفموي ، البلعوم ، الحنجرة والبلعوم السفلي. يعتبر سرطان الرأس و العنق السرطان السادس األكثر شيو ًعا في جميع أنحاء العالم حيث يتم تشخيص حوالي 000،630 مريض جديد سنويًا مما يؤدي إلى وفاة أكثر من 000،350 كل عام .فيروس الورم الحليمي واحدا من أهم عوامل الخطر في حاالت سرطان الرأس و العنق وخاصة األنواع المخاطية عالية ً البشري يعتبر المخاطر 16-HPV و 18-HPV( .NEAT1 )عبارة عن رنا نووي طويل غير مشفر يبلغ طوله 2.3

10

كيلوبايت. كما يُعرف أي ًضا باسم الحمض النووي الريبوزي غير ال ُمشفّر Coding-Non Inducible Virus( (RNA ،والذي سيُستخدم في هذه الدراسة كعامل تكهني لسرطان الرأس و العنق المرتبط بفيروس الورم الحليمي البشري. أجريت الدراسة الحالية على 50 شخ ًصا. أربعون منهم من المرضى الذين يعانون من سرطان الرأس والرقبة وعشرون اخرون أصحاء. تم الحصول على فرق كبير معنوي لتعبير NEAT1_Lnc عندما تمت مقارنة مرضى فيروس الورم الحليمي البشري اإليجابي بالمرضى السلبيين. استنتجنا أنه يمكن استخدام NEAT1كمؤشر بيولوجي تشخيصي لـسرطان الرأس و العنق المرتبط بفيروس الورم الحليمي البشري.